ד"ר אהוד ורנר למד רפואה בבית הספר לרפואה בהדסה עין כרם בירושלים.
את ההתמחות ברפואת עור הוא סיים בבית החולים העמק בעפולה בשנת 1987.
לאחר סיום ההתמחות הוא עבד כרופא עור בכיר כיועץ העור של בית החולים ברזילי.
במקביל הוא הקים מרפאה עצמאית לרפואת עור ברחובות וצבר ניסיון רב באבחון וטיפול
בתחומים השונים של רפואת העור.
במשך תקופה זו ד"ר אהוד ורנר עסק בכתיבה והוראה בתחום רפואת העור וכתב מאמרים
רבים בעיתונות הרפואית .
בשנת 2008 הוא הצטרף למרפאה לרפואת עור ואסתטיקה בקרית אונו.
משנת 2009-2013 ד"ר ורנר שימש כעורך ראשי של כתב העת הישראלי לכירורגיה
דרמטולוגית ודרמטולוגיה.
ד"ר אהוד ורנר חבר באיגוד רופאי העור הישראלי, בחברה הישראלית לכירורגיה דרמטולוגית,
באיגוד האמריקאי לדרמטולוגיה (American Academy of Dermatology), באיגוד האירופאי למחלות
עור ומין (European Academy of Dermatology and Venerology).