ד"ר שי שפי הנו בוגר הפקולטה לרפואה של האוניברסיטה העברית והדסה בירושלים.
את התמחותו באורולוגיה השלים במרכז הרפואי שיבא, תל-השומר.
לאחר מכן, עבר התמחות-על רשמית (Fellowship) באנדרולוגיה (פוריות הגבר והפרעות בתפקוד המיני),
במשך שנתיים ב- University of California, San Francisco) UCSF). זהו אחד המרכזים הרפואיים
המובילים בארה"ב ובעולם כולו, אשר מדורג דרך קבע באחד מעשרת המקומות הראשונים (Top Ten) בדירוג
בתי-החולים בארה"ב.
בעבודתו ב-UCSF, הפועל כמרכז שלישוני להפניית מקרים מורכבים (Tertiary Referral Center)
לבריאות הגבר, ומנקז מטופלים מרחבי ארה"ב ומהעולם כולו, נחשף ד"ר שפי למספר רב של מטופלים,
ובמגוון הרחב ביותר האפשרי של בעיות בתחום האנדרולוגיה. במקביל, השתלם בשיטות האבחנה והטיפול
המתקדמות ביותר, לרבות מיקרוכירורגיה (ניתוחים המבוצעים בעזרת מיקרוסקופ ניתוחי מיוחד).
עם חזרתו לישראל, השתלב ביחידה לפריון הגבר ובמחלקה האורולוגית במרכז הרפואי שיבא.
החל משנת 2008 החליט להקדיש את מירב זמנו לבריאות הגבר, וברמה המקצועית הגבוהה ביותר,
ומאז הוא מנהל מרפאה אנדרולוגית עצמאית, כשהוא משמש כחלוץ המיקרוכירורגיה בתחום פוריות הגבר בישראל.
ד"ר שפי פרסם עשרות מאמרים ופרקים בכתבי עת רפואיים ובספרים, ובהיותו בר-סמכא באנדרולוגיה,
מבוקשים שירותיו כמרצה בתחום, לקהל הרופאים ולבעלי ענין אחרים.
החל משנת 2011 משמש ד"ר שפי כמנהל בפורום פוריות הגבר באתר BeOk.
ד"ר שפי חבר מן המניין באיגודים ובחברות הבאות:
איגוד האורולוגים הישראלי
החברה הישראלית להפרעות בתפקוד המיני
החברה הישראלית לחקר וטיפול בגבר המבוגר
American Urological Association
American Society of Andrology
International Society of Andrology
European Society for Sexual Medicine
International Society for Sexual Medicine